Виталий. Я очень рад, что вы знаете разницу между средой разработки и инструментами. В своем определении вы позиционирует Notepad++ как среду разработки, однако, это всегда было инструментом и таковым является. Вобще-то я не программер, я тестировщик, PHP - это хобии, иногда приходится делать приложения, в виду нехватки ресурсов(человеков) и прямых рук.
Что касается автоматизации. За проектирование не скажу, а вот что касается тестирования, то все что можно все автоматизировано. Так же, одно время использовалась и VS. Про VS я знаю достаточно, т.к. сам поднимал VS Team Foundation Server, занимался его настройкой и администрированием.